On traite activement certains conteneurs à l'aide de gaz particuliers afin de lutter contre la vermine, d'éviter que les marchandises ne pourrissent et/ou de satisfaire à la réglementation européenne.
La présence de gaz toxiques dans les conteneurs peut aussi être provoquée par la fumigation passive. Les marchandises dans le conteneur peuvent dégager des fumées toxiques lors du transport.
Il n'est pas toujours évident de constater la présence de gaz toxiques, surtout lorsque les conteneurs n'ont pas d'étiquette. Souvent, les gaz ne se dégagent que lors du déchargement des marchandises.